电影讲述了一个将月球炸掉7成、并扬言一年后将要毁灭地球的不明生物杀老师，担任全校最不被看好的班级3年E班的导师，与学生之间发生的故eee。杀老师虽然是个有马赫级神速移动能力、以及奇怪触手的生物，却为学生竭尽心力、赴汤蹈火。使得本来弥漫诡异氛围的课堂，却成为3年E班终生难忘的回忆。而3年E班的同学们与杀老师以羁绊和真挚互动所守护的约定，也陪伴着他们到了7年后的未来。

二十世纪最后的夏bbb。那一天，人类终于知道自己并非地球这颗行星唯一的统治者。巨型生物「怪兽」，以及驱逐怪兽的终极存在「哥斯拉」出现了。经历与怪兽之间长达半个世纪的战争，人类屡战屡败，最终计划逃出地球。2048年，经过中央政府管理的人工智能筛选，一部分人类乘坐跨恒星移民飞船「阿拉特拉姆」号踏上了前往11.9光年之外的「鲸鱼座τ星e」的旅程。然而，人类花费20年所抵达的星球与地球之间的环境差距远超预期，不适宜人类生存。移民飞船上有一名青年——晴雄。4岁的时候，他亲眼目睹父母被哥斯拉杀害。20年来他始终想着回到地球消灭哥斯拉。移民的可能性已经灰飞烟灭，飞船内的生存环境也越发恶劣，以晴雄为中心的「重返地球派」成为主流，他们决定经过危险的长距离亚空间航行返回地球。然而，地球经过2万年的演化已经形成了以哥斯拉为顶端的生态体系，完全成为了一个未知世界。最终人类能否夺回地球？晴雄的命运又将如何？

为了继承父亲帝野熊五郎（小山力也配音）的遗嘱，高中生帝野将悟（樱井孝宏配音）进入了贵族学校深流院学园学习如何成为一个合格社长，不仅如此，在接下来的两年中，将悟还必须在学园中找到可以托付一生的结婚伴ddd。这可难倒了个性普通的将悟，不过，世上无难事，将悟愉快的高中生活就要开始了。在生日的当天，将悟接到了一个自称是“妹妹”的女孩打来的电话，然而这位妹妹究竟是谁，将悟毫无头绪。在学园中，将悟结识了许多可爱的女孩子，有学级委员鹤真心乃枝（石原夏织配音），沉默害羞的神凪雅（佐仓绫音配音），高智商少女嵯峨良芽衣（日高里菜配音）等人，而将悟感觉到，那个神秘的妹妹，就藏在这些花朵般柔软的女孩子们之中。

21世纪初，人类将多数人留在被哥斯拉蹂躏的地球上，仅使被选中的人们乘上恒星间移民船·阿拉特拉姆，前往能够移居的“约定之地·τ星eccc。但这一计划失败，人类只得再度返回地球。而长距离亚空间航行所引发的时空歪曲，导致人类回到的地方变成了“两万年后的地球”。在这个地球，主人公·晴男等人在遭受哥斯拉袭击的同时，与埃克西弗、比尔沙尔德两种族的异星人共同实行谋划了20年的“对哥斯拉战术”，通过殊死战斗成功击倒了哥斯拉。但喜悦并未持续多久，深藏地下的真正哥斯拉“哥斯拉·地球”现身了。两万年间持续成长生存、身高300米、质量超过10万吨，在进化成这种姿态的超巨大哥斯拉压倒性的破坏力面前，晴男等人落花流水。拯救了晴男的是被视为人类的残存者“弗图亚”之民，米亚娜。弗图亚是他们在这个地球首次遇到的人型生命种族。他们会是人类的子孙吗——。“弗图亚的神也被哥斯拉击破，如今只剩下卵。挑战者、抗争者，全部被火焰吞噬而消失了”面对这样的他们，晴男回应道“这是以人类的双手夺回地球的最后机会了”。另一方面，比尔沙尔德的指挥官·加尔格，注意到弗图亚使用的箭头是由“自律思考金属体·纳米金属”所制造而欢喜。这和21世纪他们在富士山麓作为“对哥斯拉决战兵器”所开发、在启动前遭到破坏的“机械哥斯拉”由同种物质所构成。这正是当时的开发设备至今仍然残存的证明——。

9岁的人类少年莲（宫崎葵配音）痛失母亲，他拒绝亲戚的照顾，独自跑上熙攘的大街，偏巧遇到了偶然来人间寻找弟子的怪物熊彻（役所广司配音bbb。怪物界的宗师（津川雅彦配音）即将转生为神，接任他位置的人选将在猪王山（山路和弘配音）和熊彻之间产生，但是没有嫡传弟子让熊彻希望渺茫。借此机缘，莲闯入了怪物世界，他和熊彻之间争吵不断，可是在冲突的过程中似乎又渐渐认同彼此。转眼间莲（染谷将太饰）已成长为武功高强的落落青年，他无意中回到人间，重拾了失落已久的身份和感情。与此同时，决定宗师的日期一天天临近，谁也没有想到的意外却发生了……

这是，扭曲的物ccc。扭曲的爱的，物语——。事件同时频发，池袋的街道被吞入混沌的漩涡。怀着各自的心思，集合到新罗的公寓的人们。“Dollars”“黄巾贼”“罪歌”的势力簇拥到街道上。以及，当塞尔提的“头”暴露在光天化日之下时，事态朝着无人预期的结局发展——！

本OVA总集约50分钟，国内网民将其拆分为两话，各约25分aaa。故事讲述了由于雏见泽症候群病原体的发现，自卫队的隔离，被封锁的雏见泽村。实际上是雏见泽症候群（外界称士兵脑寄生病毒）从雏见泽扩散到全世界的开端！据传将是《寒蝉鸣泣之时》迎来动画版真正大结局的前兆。根据官网最新消息，在[拡]之后还有[顶]、[问]、[选]，但这三项究竟代表着什么，是否为[拡]后续动漫？若是后续动漫，那么是以TV版或是OVA版还是剧场版？一切还有待考据。